Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZDHHC3Q9NYG2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZDHHC3Q9NYG2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZDHHC3Q9NYG2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZDHHC3Q9NYG2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZDHHC3Q9NYG2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZDHHC3Q9NYG2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZDHHC3Q9NYG2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZDHHC3Q9NYG2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ZDHHC3Q9NYG2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ZDHHC3Q9NYG2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms