Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMPD3Q9NY59 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.7 ms