Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK13-1Q9NX77 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK13-1Q9NX77 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK13-1Q9NX77 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK13-1Q9NX77 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK13-1Q9NX77 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK13-1Q9NX77 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK13-1Q9NX77 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK13-1Q9NX77 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK13-1Q9NX77 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK13-1Q9NX77 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK13-1Q9NX77 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK13-1Q9NX77 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK13-1Q9NX77 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK13-1Q9NX77 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK13-1Q9NX77 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK13-1Q9NX77 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK13-1Q9NX77 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK13-1Q9NX77 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK13-1Q9NX77 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK13-1Q9NX77 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms