Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTLC3Q9NUV7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms