Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms