Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD9

FARSB, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSBQ9NSD9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FARSBQ9NSD9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms