Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOPORSQ9NS56 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms