Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms