Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNNM1Q9NRU3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms