Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRC6

SPTBN5, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN5Q9NRC6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTBN5Q9NRC6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPTBN5Q9NRC6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPTBN5Q9NRC6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPTBN5Q9NRC6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTBN5Q9NRC6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTBN5Q9NRC6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTBN5Q9NRC6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTBN5Q9NRC6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTBN5Q9NRC6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTBN5Q9NRC6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTBN5Q9NRC6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTBN5Q9NRC6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTBN5Q9NRC6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTBN5Q9NRC6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTBN5Q9NRC6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTBN5Q9NRC6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTBN5Q9NRC6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTBN5Q9NRC6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTBN5Q9NRC6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTBN5Q9NRC6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTBN5Q9NRC6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTBN5Q9NRC6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTBN5Q9NRC6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms