Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms