Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPHNQ9NQX3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GPHNQ9NQX3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms