Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ79

CRTAC1, Cartilage acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAC1Q9NQ79 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRTAC1Q9NQ79 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms