Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC8

SIX2, Homeobox protein SIX2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX2Q9NPC8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SIX2Q9NPC8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX2Q9NPC8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms