Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCNB1IP1Q9NPC3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms