Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP81

SARS2, Serine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARS2Q9NP81 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SARS2Q9NP81 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SARS2Q9NP81 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SARS2Q9NP81 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SARS2Q9NP81 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SARS2Q9NP81 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SARS2Q9NP81 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SARS2Q9NP81 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SARS2Q9NP81 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SARS2Q9NP81 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SARS2Q9NP81 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SARS2Q9NP81 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SARS2Q9NP81 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SARS2Q9NP81 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SARS2Q9NP81 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SARS2Q9NP81 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SARS2Q9NP81 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SARS2Q9NP81 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SARS2Q9NP81 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SARS2Q9NP81 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SARS2Q9NP81 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SARS2Q9NP81 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SARS2Q9NP81 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SARS2Q9NP81 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SARS2Q9NP81 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SARS2Q9NP81 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SARS2Q9NP81 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SARS2Q9NP81 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SARS2Q9NP81 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SARS2Q9NP81 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SARS2Q9NP81 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SARS2Q9NP81 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SARS2Q9NP81 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SARS2Q9NP81 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SARS2Q9NP81 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SARS2Q9NP81 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SARS2Q9NP81 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SARS2Q9NP81 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SARS2Q9NP81 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SARS2Q9NP81 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SARS2Q9NP81 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SARS2Q9NP81 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SARS2Q9NP81 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms