Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBW1

LRRC4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4Q9HBW1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC4Q9HBW1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms