Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB90

RRAGC, Ras-related GTP-binding protein C, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGCQ9HB90 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RRAGCQ9HB90 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRAGCQ9HB90 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRAGCQ9HB90 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRAGCQ9HB90 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRAGCQ9HB90 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRAGCQ9HB90 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRAGCQ9HB90 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRAGCQ9HB90 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRAGCQ9HB90 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRAGCQ9HB90 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRAGCQ9HB90 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRAGCQ9HB90 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRAGCQ9HB90 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RRAGCQ9HB90 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRAGCQ9HB90 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRAGCQ9HB90 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRAGCQ9HB90 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRAGCQ9HB90 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRAGCQ9HB90 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRAGCQ9HB90 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRAGCQ9HB90 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms