Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9D4

ZNF408, Zinc finger protein 408, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF408Q9H9D4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF408Q9H9D4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF408Q9H9D4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF408Q9H9D4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF408Q9H9D4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF408Q9H9D4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF408Q9H9D4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF408Q9H9D4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF408Q9H9D4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF408Q9H9D4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF408Q9H9D4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF408Q9H9D4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF408Q9H9D4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF408Q9H9D4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF408Q9H9D4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF408Q9H9D4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF408Q9H9D4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF408Q9H9D4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF408Q9H9D4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF408Q9H9D4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF408Q9H9D4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF408Q9H9D4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms