Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms