Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BCAS3Q9H6U6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms