Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms