Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms