Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms