Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC8Q9H0W5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms