Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K4

RSPH6A, Radial spoke head protein 6 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH6AQ9H0K4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RSPH6AQ9H0K4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms