Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms