Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CIPCQ9C0C6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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