Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRCC1Q9C099 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRCC1Q9C099 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms