Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM8Q9BZR9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms