Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYW2

SETD2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD2Q9BYW2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SETD2Q9BYW2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SETD2Q9BYW2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SETD2Q9BYW2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SETD2Q9BYW2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
SETD2Q9BYW2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
SETD2Q9BYW2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SETD2Q9BYW2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SETD2Q9BYW2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
SETD2Q9BYW2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SETD2Q9BYW2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SETD2Q9BYW2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SETD2Q9BYW2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms