Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC9.72□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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KRTAP9-3Q9BYQ3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC9.71□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
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KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
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KRTAP9-3Q9BYQ3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
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KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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KRTAP9-3Q9BYQ3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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KRTAP9-3Q9BYQ3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
KRTAP9-3Q9BYQ3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
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