Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SALL3Q9BXA9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms