Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWT1

CDCA7, Cell division cycle-associated protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7Q9BWT1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDCA7Q9BWT1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CDCA7Q9BWT1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CDCA7Q9BWT1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDCA7Q9BWT1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDCA7Q9BWT1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDCA7Q9BWT1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDCA7Q9BWT1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDCA7Q9BWT1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDCA7Q9BWT1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDCA7Q9BWT1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDCA7Q9BWT1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDCA7Q9BWT1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDCA7Q9BWT1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDCA7Q9BWT1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDCA7Q9BWT1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDCA7Q9BWT1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CDCA7Q9BWT1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDCA7Q9BWT1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDCA7Q9BWT1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDCA7Q9BWT1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDCA7Q9BWT1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDCA7Q9BWT1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDCA7Q9BWT1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDCA7Q9BWT1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDCA7Q9BWT1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDCA7Q9BWT1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDCA7Q9BWT1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDCA7Q9BWT1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDCA7Q9BWT1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDCA7Q9BWT1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDCA7Q9BWT1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms