Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HIRIP3Q9BW71 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC30.37■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC30.33■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC30.33■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms