Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PBDC1Q9BVG4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PBDC1Q9BVG4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PBDC1Q9BVG4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PBDC1Q9BVG4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PBDC1Q9BVG4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PBDC1Q9BVG4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PBDC1Q9BVG4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PBDC1Q9BVG4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PBDC1Q9BVG4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PBDC1Q9BVG4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PBDC1Q9BVG4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PBDC1Q9BVG4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PBDC1Q9BVG4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PBDC1Q9BVG4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PBDC1Q9BVG4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PBDC1Q9BVG4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PBDC1Q9BVG4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PBDC1Q9BVG4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PBDC1Q9BVG4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PBDC1Q9BVG4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PBDC1Q9BVG4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PBDC1Q9BVG4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PBDC1Q9BVG4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PBDC1Q9BVG4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PBDC1Q9BVG4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PBDC1Q9BVG4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PBDC1Q9BVG4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PBDC1Q9BVG4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PBDC1Q9BVG4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PBDC1Q9BVG4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PBDC1Q9BVG4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms