Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COPS4Q9BT78 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
COPS4Q9BT78 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
COPS4Q9BT78 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms