Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms