Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 522.5 ms