Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms