Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TM2D3Q9BRN9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms