Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms