Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CITED2Q99967 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms