Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP8Q99708 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms