Protein–RNA interactions for Protein: Q99496

RNF2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF2Q99496 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF2Q99496 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RNF2Q99496 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF2Q99496 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF2Q99496 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF2Q99496 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF2Q99496 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF2Q99496 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF2Q99496 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF2Q99496 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF2Q99496 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF2Q99496 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF2Q99496 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF2Q99496 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF2Q99496 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF2Q99496 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF2Q99496 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF2Q99496 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF2Q99496 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF2Q99496 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF2Q99496 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms