Protein–RNA interactions for Protein: Q96T76

MMS19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19Q96T76 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMS19Q96T76 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMS19Q96T76 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms