Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN18Q96SJ8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms