Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
IFT140Q96RY7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
IFT140Q96RY7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
IFT140Q96RY7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
IFT140Q96RY7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
IFT140Q96RY7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
IFT140Q96RY7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
IFT140Q96RY7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
IFT140Q96RY7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
IFT140Q96RY7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
IFT140Q96RY7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
IFT140Q96RY7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
IFT140Q96RY7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
IFT140Q96RY7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
IFT140Q96RY7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
IFT140Q96RY7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
IFT140Q96RY7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
IFT140Q96RY7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
IFT140Q96RY7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
IFT140Q96RY7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
IFT140Q96RY7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
IFT140Q96RY7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC35.6■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
IFT140Q96RY7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
IFT140Q96RY7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
IFT140Q96RY7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
IFT140Q96RY7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
IFT140Q96RY7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
IFT140Q96RY7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
IFT140Q96RY7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
IFT140Q96RY7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
IFT140Q96RY7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
IFT140Q96RY7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
IFT140Q96RY7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms