Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UIMC1Q96RL1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms