Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB3IPQ96QF0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3IPQ96QF0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms